Ūdens dzesētāja struktūra galvenokārt sastāv no šādām sastāvdaļām:
1. Dzesētājs: parasti izgatavots no tādiem materiāliem kā alumīnija sakausējumi un tērauds, tā konstrukcijas dizains palielina virsmas laukumu un siltuma izkliedi, panākot efektīvāku siltuma izkliedi.
2. Ūdens sūknis: ūdens sūknis ir būtiska sastāvdaļa, kas virza ūdens plūsmu dzesēšanai. Parasti tas ir centrbēdzes vai pārvietojams sūknis.
3. Ūdens tvertne: parasti izgatavota no korozijizturīgiem-materiāliem, piemēram, nerūsējošā tērauda vai alumīnija sakausējumiem, tās izmēru var pielāgot atbilstoši projekta vajadzībām.
4. Cauruļvadu sistēma: Cauruļu sistēma savieno dzesētāju, ūdens tvertni un ūdens sūkni. Plūsmu un spiedienu var kontrolēt, izmantojot plūsmas regulēšanas vārstus un manometrus.
5. Vadības sistēma: Vadības sistēma, kas sastāv no temperatūras regulatoriem, sensoriem un slēdžiem, ļauj automatizēti kontrolēt iekārtu, uzlabojot tās stabilitāti un drošību.